Desde 2015 se fue a probar suerte en el exótico futbol de Malasia
Mora llegó al futbol de Malasia en diciembre del 2015 con la filial del Johor Darul Ta’zim, Johor II, después de conseguir su licencia UEFA de director técnico.
Desde el 2018 es el técnico del primer equipo y ha logrado cosechar varios éxitos.
En entrevista con ESPN en 2022, Benjamín Mora reconoció que dos equipos de la Liga MX lo han buscado, pero que se negó a salir de Malasia porque no le hicieron una propuesta que le llamara la atención.